热血高中生野球部的废物投手——大和田刚，拥有天赋异禀的臂力，却因为控球太差被队友嘲笑为“巨棒”。某天，他遇到了一个自称是“棒球精灵”的娇小神秘少年——小玉。小玉告诉他，只要通过一系列“奇葩训练”就能觉醒真正的“炸裂球技”。从此，大和田跟着小玉进行了各种匪夷所思的特训：背着石头跑步、用筷子夹苍蝇、在瀑布下冥想……在欢笑与汗水交织中，大和田不仅球技突飞猛进，更与小玉建立起了超越师徒的深厚感情。
甲子园决赛，九局下半，满垒，大和田刚站上投手丘。对面是号称全国最强的打者，全场屏息。小玉化作一道光附在球上，大和田投出了人生中最完美的一球——球在进入捕手手套前，突然炸裂成漫天星光，打者挥空。比赛结束，胜利属于他们。
大和田的宿敌、天才打者御子柴来到他们的练习场，指名要和大和田对决。在众人的注视下，大和田用出了小玉教的“炸裂球”，球路诡异地一分为二，让御子柴挥棒落空，输得心服口服，并承认大和田是他认可的对手。
小玉为了让大和田掌握“变化球”的精髓，在暴雨中进行特训。大和田要在泥泞的投手丘上投出上百球，直到手臂抬不起来。训练结束后，小玉用自己“精灵”的力量替他按摩手臂，两人第一次有了肢体接触，气氛微妙。
大和田无意中发现，小玉的身体在逐渐变得透明。小玉解释说，他的存在是为了帮助有潜力的人觉醒，一旦任务完成，他就会消失。大和田第一次感到恐惧，他不想失去这个每天陪他练球、骂他又鼓励他的小老师。
大和田带领自己的临时队伍参加地区预选赛，在第三局落后5分的情况下，他用小玉教的“看不见的魔球”连续三振对方三名打者，士气大振，最终逆转比赛，成功晋级，震惊了整个棒球部。
大和田因为投球太差被赶出练习场，一个人在仓库里对着旧棒球泄愤。这时，一个巴掌大小、穿着迷你棒球服的光球从旧手套里飘出来，自称小玉，说要让他成为“球场上最炸裂的男人”。